实现一个简单的Database10(译文)

2023年5月10日 85点热度 0人点赞 0条评论

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作者：花家舍
文章来源：GreatSQL社区原创

前文回顾

实现一个简单的Database系列

译注：cstack在github维护了一个简单的、类似sqlite的数据库实现，通过这个简单的项目，可以很好的理解数据库是如何运行的。本文是第十篇，主要是实现B-tree中叶子节点分裂

Part 10 叶子节点分裂

我们 B-Tree 只有一个节点，这看起来不太像一棵标准的 tree。为了解决这个问题，需要一些代码来实现分裂叶子节点。在那之后，需要创建一个内部节点，使其成为两个新的叶子节点的父节点。

基本上，我们这个系列的文章的目标是从这里开始的：

one-node btree

到这样：

two-level btree

首先中的首先，先把处理节点写满错误移除掉：

void leaf_node_insert(Cursor* cursor, uint32_t key, Row* value) {
  void* node = get_page(cursor->table->pager, cursor->page_num);

  uint32_t num_cells = *leaf_node_num_cells(node);
  if (num_cells >= LEAF_NODE_MAX_CELLS) {
    // Node full
-    printf("Need to implement splitting a leaf node.\n");
-    exit(EXIT_FAILURE);
+    leaf_node_split_and_insert(cursor, key, value);
+    return;
  }
ExecuteResult execute_insert(Statement* statement, Table* table) {
   void* node = get_page(table->pager, table->root_page_num);
   uint32_t num_cells = (*leaf_node_num_cells(node));
-  if (num_cells >= LEAF_NODE_MAX_CELLS) {
-    return EXECUTE_TABLE_FULL;
-  }

   Row* row_to_insert = &(statement->row_to_insert);
   uint32_t key_to_insert = row_to_insert->id;

分裂算法（Splitting Algorithm）

简单的部分结束了。以下是我们需要做的事情的描述（出自：SQLite Database System: Design and Implementation）
原文：If there is no space on the leaf node, we would split the existing entries residing there and the new one (being inserted) into two equal halves: lower and upper halves. (Keys on the upper half are strictly greater than those on the lower half.) We allocate a new leaf node, and move the upper half into the new node.
翻译：如果在叶子节点中已经没有空间，我们需要将驻留在节点中的现有条目和新条目（正在插入）分成相等的两半：低半部分和高半部分（在高半部分中的键要严格大于低半部分中的键）。我们分配一个新的节点，将高半部分的条目移到新的节点中。

现在来处理旧节点并创建一个新的节点：

+void leaf_node_split_and_insert(Cursor* cursor, uint32_t key, Row* value) {
+  /*
+  Create a new node and move half the cells over.
+  Insert the new value in one of the two nodes.
+  Update parent or create a new parent.
+  */
+
+  void* old_node = get_page(cursor->table->pager, cursor->page_num);
+  uint32_t new_page_num = get_unused_page_num(cursor->table->pager);
+  void* new_node = get_page(cursor->table->pager, new_page_num);
+  initialize_leaf_node(new_node);

接下来，拷贝节点中每一个单元格到新的位置：

+  /*
+  All existing keys plus new key should be divided
+  evenly between old (left) and new (right) nodes.
+  Starting from the right, move each key to correct position.
+  */
+  for (int32_t i = LEAF_NODE_MAX_CELLS; i >= 0; i--) {
+    void* destination_node;
+    if (i >= LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT) {
+      destination_node = new_node;
+    } else {
+      destination_node = old_node;
+    }
+    uint32_t index_within_node = i % LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT;
+    void* destination = leaf_node_cell(destination_node, index_within_node);
+
+    if (i == cursor->cell_num) {
+      serialize_row(value, destination);
+    } else if (i > cursor->cell_num) {
+      memcpy(destination, leaf_node_cell(old_node, i - 1), LEAF_NODE_CELL_SIZE);
+    } else {
+      memcpy(destination, leaf_node_cell(old_node, i), LEAF_NODE_CELL_SIZE);
+    }
+  }

更新节点中头部标记的单元格的数量（更新node’s header）

+  /* Update cell count on both leaf nodes */
+  *(leaf_node_num_cells(old_node)) = LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT;
+  *(leaf_node_num_cells(new_node)) = LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT;

然后我们需要更新节点的父节点。如果原始节点是一个根节点（root node），那么他就没有父节点。这种情况中，创建一个新的根节点来作为它的父节点。这里做另外一个存根（先不具体实现）：

+  if (is_node_root(old_node)) {
+    return create_new_root(cursor->table, new_page_num);
+  } else {
+    printf("Need to implement updating parent after split\n");
+    exit(EXIT_FAILURE);
+  }
+}

分配新的页面（Allocating New Pages）

让我们回过头来定义一些函数和常量。当我们创建一个新的叶子节点，我们把它放进一个由get_unused_page_num()函数决定(返回)的页中。

+/*
+Until we start recycling free pages, new pages will always
+go onto the end of the database file
+*/
+uint32_t get_unused_page_num(Pager* pager) { return pager->num_pages; }

现在，我们假定在一个数据库中有N个数据页，页编码从 0 到 N-1 的页已经被分配。因此我们总是可以为一个新页分配页 N编码。在我们最终实现删除（数据）操作后，一些页可能会变成空页，并且他们的页编号可能没有被使用。为了更有效率，我们会回收这些空闲页。

叶子节点的大小（Leaf Node Sizes）

为了保持的树的平衡，我们在两个新的节点之间平等的分发单元格。如果一个叶子节点可以hold住 N 个单元格，那么在分裂期间我们需要分发 N + 1 个单元格在两个节点之间（N 个原有的单元格和一个新插入的单元格）。如果 N+1 是奇数，我比较随意地选择了左侧节点获取多的那个单元格。

+const uint32_t LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT = (LEAF_NODE_MAX_CELLS + 1) / 2;
+const uint32_t LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT =
+    (LEAF_NODE_MAX_CELLS + 1) - LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT;

创建新根节点（Creating a New Root）

这里是“SQLite Database System”描述的创建一个新根节点的过程：
原文：Let N be the root node. First allocate two nodes, say L and R. Move lower half of N into L and the upper half into R. Now N is empty. Add 〈L, K,R〉 in N, where K is the max key in L. Page N remains the root. Note that the depth of the tree has increased by one, but the new tree remains height balanced without violating any B+-tree property.
翻译：设 N 为根节点。先分配两个节点，比如 L 和 R。移动 N 中低半部分的条目到 L 中，移动高半部分条目到 R 中。现在 N 已经空了。增加 〈L, K,R〉到 N 中，这里 K 是 L 中最大 key 。页 N 仍然是根节点。注意这时树的深度已经增加了一层，但是在没有违反任何 B-Tree 属性的情况下，新的树仍然保持了高度上平衡。

此时，我们已经分配了右子节点并移动高半部分的条目到这个子节点。我们的函数把这个右子节点作为输入，并且分配一个新的页面来存放左子节点。

+void create_new_root(Table* table, uint32_t right_child_page_num) {
+  /*
+  Handle splitting the root.
+  Old root copied to new page, becomes left child.
+  Address of right child passed in.
+  Re-initialize root page to contain the new root node.
+  New root node points to two children.
+  */
+
+  void* root = get_page(table->pager, table->root_page_num);
+  void* right_child = get_page(table->pager, right_child_page_num);
+  uint32_t left_child_page_num = get_unused_page_num(table->pager);
+  void* left_child = get_page(table->pager, left_child_page_num);

旧的根节点已经被拷贝到左子节点，所以我们可以重用根节点（无需重新分配）：

+  /* Left child has data copied from old root */
+  memcpy(left_child, root, PAGE_SIZE);
+  set_node_root(left_child, false);

最后我们初始化根节点作为一个新的、有两个子节点的内部节点。

+  /* Root node is a new internal node with one key and two children */
+  initialize_internal_node(root);
+  set_node_root(root, true);
+  *internal_node_num_keys(root) = 1;
+  *internal_node_child(root, 0) = left_child_page_num;
+  uint32_t left_child_max_key = get_node_max_key(left_child);
+  *internal_node_key(root, 0) = left_child_max_key;
+  *internal_node_right_child(root) = right_child_page_num;
+}

内部节点格式（Internal Node Format）

现在我们终于创建了内部节点，我们就不得不定义它的布局了。它从通用 header 开始，然后是它包含的 key 的数量，接下来是它右边子节点的页号。内部节点的子节点指针始终比它的 key 的数量多一个。这个子节点指针存储在 header 中。

+/*
+ * Internal Node Header Layout
+ */
+const uint32_t INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET = COMMON_NODE_HEADER_SIZE;
+const uint32_t INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_OFFSET =
+    INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET + INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE;
+const uint32_t INTERNAL_NODE_HEADER_SIZE = COMMON_NODE_HEADER_SIZE +
+                                           INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE +
+                                           INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_SIZE;

内部节点的 body 是一个单元格的数组，每个单元格包含一个子指针和一个 key 。每个 key 都必须是它的左边子节点中包含的最大 key 。

+/*
+ * Internal Node Body Layout
+ */
+const uint32_t INTERNAL_NODE_KEY_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_CELL_SIZE =
+    INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE + INTERNAL_NODE_KEY_SIZE;

基于这些常量，下边是内部节点布局看上去的样子：

Our internal node format

注意我们巨大的分支因子（也就是扇出）。因为每个子节点指针/键对儿（child pointer / key pair）太小了，我们可以在每个内部节点中容纳 510 个键和 511 个子指针（也就是每个内部节点可以有510个子节点）。这意味着我们从来不用在查找 key 时遍历树的很多层。

# internal node layers	max # leaf nodes	Size of all leaf nodes
0	511^0 = 1	4 KB
1	511^1 = 512	~2 MB
2	511^2 = 261,121	~1 GB
3	511^3 = 133,432,831	~550 GB

实际上，我们不能在每个叶子节点中存储满 4KB 的数据，这是因为存储 header 、 keys 的开销和空间的浪费。但是我们可以通过从磁盘上加载 4 个 pages （树高四层，每层只需检索一页）来检索大约 500G 的数据。这就是为什么 B-Tree 对数据库来说是很有用的数据结构。

下边是读取和写入一个内部节点的方法：

+uint32_t* internal_node_num_keys(void* node) {
+  return node + INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET;
+}
+
+uint32_t* internal_node_right_child(void* node) {
+  return node + INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_OFFSET;
+}
+
+uint32_t* internal_node_cell(void* node, uint32_t cell_num) {
+  return node + INTERNAL_NODE_HEADER_SIZE + cell_num * INTERNAL_NODE_CELL_SIZE;
+}
+
+uint32_t* internal_node_child(void* node, uint32_t child_num) {
+  uint32_t num_keys = *internal_node_num_keys(node);
+  if (child_num > num_keys) {
+    printf("Tried to access child_num %d > num_keys %d\n", child_num, num_keys);
+    exit(EXIT_FAILURE);
+  } else if (child_num == num_keys) {
+    return internal_node_right_child(node);
+  } else {
+    return internal_node_cell(node, child_num);
+  }
+}
+
+uint32_t* internal_node_key(void* node, uint32_t key_num) {
+  return internal_node_cell(node, key_num) + INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE;
+}

对于一个内部节点，最大 key 始终是其右键。对于一个叶子节点，最大 key 就是最大索引键。

+uint32_t get_node_max_key(void* node) {
+  switch (get_node_type(node)) {
+    case NODE_INTERNAL:
+      return *internal_node_key(node, *internal_node_num_keys(node) - 1);
+    case NODE_LEAF:
+      return *leaf_node_key(node, *leaf_node_num_cells(node) - 1);
+  }
+}

追踪根节点（Keeping Track of the Root）

我们终于在通用的节点 header 中使用了 is_root 字段。回调它是我们用它来决定怎样来分裂一个叶子节点：

    if (is_node_root(old_node)) {
        return create_new_root(cursor->table, new_page_num);
    } else {
        printf("Need to implement updating parent after split\n");
        exit(EXIT_FAILURE);
    }
}

下面是 getter & setter：

+bool is_node_root(void* node) {
+  uint8_t value = *((uint8_t*)(node + IS_ROOT_OFFSET));
+  return (bool)value;
+}
+
+void set_node_root(void* node, bool is_root) {
+  uint8_t value = is_root;
+  *((uint8_t*)(node + IS_ROOT_OFFSET)) = value;
+}

初始化这两种类型的节点（内部节点&叶子节点）应默认设置 is_root 为 false。

void initialize_leaf_node(void* node) {
  set_node_type(node, NODE_LEAF);
+  set_node_root(node, false);
  *leaf_node_num_cells(node) = 0;
}

+void initialize_internal_node(void* node) {
+  set_node_type(node, NODE_INTERNAL);
+  set_node_root(node, false);
+  *internal_node_num_keys(node) = 0;
+}

当创建表的第一个节点时我们需要设置 is_root 为 true 。

// New database file. Initialize page 0 as leaf node.
void* root_node = get_page(pager, 0);
initialize_leaf_node(root_node);
+    set_node_root(root_node, true);
}

return table;

打印树（Printing the Tree）

为了帮助我们可视化数据库的状态，我们应该更新我们的 .btree 元命令以打印多级树。

我要替换当前的 print_leaf_node（）函数：

-void print_leaf_node(void* node) {
-  uint32_t num_cells = *leaf_node_num_cells(node);
-  printf("leaf (size %d)\n", num_cells);
-  for (uint32_t i = 0; i < num_cells; i++) {
-    uint32_t key = *leaf_node_key(node, i);
-    printf("  - %d : %d\n", i, key);
-  }
-}

实现一个递归函数，可以接受任何节点，然后打印它和它的子节点。它接受一个缩进级别作为参数，缩进级别每次在每次递归时会递增。我还在缩进中添加了一个很小的辅助函数。

+void indent(uint32_t level) {
+  for (uint32_t i = 0; i < level; i++) {
+    printf("  ");
+  }
+}
+
+void print_tree(Pager* pager, uint32_t page_num, uint32_t indentation_level) {
+  void* node = get_page(pager, page_num);
+  uint32_t num_keys, child;
+
+  switch (get_node_type(node)) {
+    case (NODE_LEAF):
+      num_keys = *leaf_node_num_cells(node);
+      indent(indentation_level);
+      printf("- leaf (size %d)\n", num_keys);
+      for (uint32_t i = 0; i < num_keys; i++) {
+        indent(indentation_level + 1);
+        printf("- %d\n", *leaf_node_key(node, i));
+      }
+      break;
+    case (NODE_INTERNAL):
+      num_keys = *internal_node_num_keys(node);
+      indent(indentation_level);
+      printf("- internal (size %d)\n", num_keys);
+      for (uint32_t i = 0; i < num_keys; i++) {
+        child = *internal_node_child(node, i);
+        print_tree(pager, child, indentation_level + 1);
+
+        indent(indentation_level + 1);
+        printf("- key %d\n", *internal_node_key(node, i));
+      }
+      child = *internal_node_right_child(node);
+      print_tree(pager, child, indentation_level + 1);
+      break;
+  }
+}

并更新对 print 函数的调用，传递缩进级别为零。

} else if (strcmp(input_buffer->buffer, ".btree") == 0) {
  printf("Tree:\n");
-    print_leaf_node(get_page(table->pager, 0));
+    print_tree(table->pager, 0, 0);
  return META_COMMAND_SUCCESS;

下面是一个对新的打印函数的测例

+  it 'allows printing out the structure of a 3-leaf-node btree' do
+    script = (1..14).map do |i|
+      "insert #{i} user#{i} person#{i}@example.com"
+    end
+    script << ".btree"
+    script << "insert 15 user15 person15@example.com"
+    script << ".exit"
+    result = run_script(script)
+
+    expect(result[14...(result.length)]).to match_array([
+      "db > Tree:",
+      "- internal (size 1)",
+      "  - leaf (size 7)",
+      "    - 1",
+      "    - 2",
+      "    - 3",
+      "    - 4",
+      "    - 5",
+      "    - 6",
+      "    - 7",
+      "  - key 7",
+      "  - leaf (size 7)",
+      "    - 8",
+      "    - 9",
+      "    - 10",
+      "    - 11",
+      "    - 12",
+      "    - 13",
+      "    - 14",
+      "db > Need to implement searching an internal node",
+    ])
+  end

新格式有点简化，所以我们需要更新现有的 .btree 测试：

"db > Executed.",
"db > Executed.",
"db > Tree:",
-      "leaf (size 3)",
-      "  - 0 : 1",
-      "  - 1 : 2",
-      "  - 2 : 3",
+      "- leaf (size 3)",
+      "  - 1",
+      "  - 2",
+      "  - 3",
"db > "
])
end

这是新测试本身的 .btree 输出：

Tree:
- internal (size 1)
  - leaf (size 7)
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 5
    - 6
    - 7
  - key 7
  - leaf (size 7)
    - 8
    - 9
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 14

在缩进最小的级别，我们看到根节点（一个内部节点）。它输出的 size 为 1 因为它有一个 key 。缩进一个级别，我们看到叶子节点，一个 key ，和一个叶子节点。根节点中的 key （7）是第一个左子节点中最大的 key 。每个大于7的 key 存放在第二个子节点中。

一个主要问题（A Major Problem）

如果你一直密切关注，你可能会注意到我们错过了一些大事。看看如果我们尝试插入额外一行会发生什么：

db > insert 15 user15 person15@example.com
Need to implement searching an internal node

哦吼！是谁写的TODO信息？（作者在故弄玄虚！明明是他自己在 table_find() 函数中把内部节点搜索的功能存根的！）

下次我们将通过在多级树上实现搜索来继续史诗般的 B 树传奇。

Enjoy GreatSQL 😃

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